Anche l'antibiotico-profilassi di routine lascia un segno sul microbiota

L'antibiotico-profilassi è prassi routinaria prima di molte procedure di chirurgia dentale, eppure come questa effettivamente rimodelli il microbiota orale e intestinale — e se tale perturbazione si risolva — è rimasto sorprendentemente poco studiato. Questo studio di coorte prospettico ha seguito 64 pazienti sottoposti a chirurgia dentale con antibiotico-profilassi, raccogliendo saliva e feci al basale e poi a 3, 10, 30 e 90 giorni post-operatori, con sequenziamento 16S rRNA sull'intera coorte e metagenomica shotgun su un sottogruppo per tracciare i geni di resistenza antimicrobica.

Sia il microbiota orale sia quello intestinale hanno mostrato cali significativi di alfa-diversità (p<0,01), più marcati ai giorni 3 e 10, con un recupero quasi completo al basale entro il giorno 90 — confermando l'ipotesi degli autori di una perturbazione seguita da recupero. In particolare, il microbiota orale è risultato più perturbato di quello intestinale, un dato che suggerisce una suscettibilità all'esposizione antibiotica postoperatoria maggiore di quanto comunemente si ritenga. Fattori legati al paziente — sesso, etnia, malattia da reflusso gastroesofageo e tipo di antibiotico utilizzato — hanno influenzato sia la diversità al basale sia il grado di perturbazione e la velocità di recupero. L'analisi tassonomica ha mostrato variazioni sostanziali nei generi batterici associati alla salute dopo l'intervento, e — il dato con l'ombra pratica più lunga — alcuni geni di resistenza antimicrobica sono aumentati in abbondanza relativa nel tempo anziché regredire, un segnale di possibili conseguenze ecologiche durature anche da un singolo ciclo profilattico.

Il messaggio pratico non è abbandonare la profilassi, ma riconoscere che non è microbiologicamente gratuita: anche un regime antibiotico standard a ciclo singolo perturba in modo misurabile sia l'ecosistema orale sia quello intestinale, la perturbazione e il recupero variano da paziente a paziente, e l'arricchimento in geni di resistenza può superare la finestra di recupero clinico. Gli autori la inquadrano esplicitamente come un argomento di stewardship antibiotica — le decisioni sulla profilassi dovrebbero pesare i fattori specifici del paziente, non solo il tipo di procedura.